Опоры для гигантского моста стали строить, по ранее не применявшейся технологии, с помощью кессонов. Глубина Ист-ривер, с бруклинской стороны, составляла 14 метров, а с манхэттенской 25. Кессон представлял собой гигантскую коробку без дна, размером 50 на 30 метров, разделенную на шесть отсеков. В затопленный кессон нагнетали сжатый воздух, в результате чего, вода вытеснялась давлением. К обычному, в таких условиях травматизму, добавилась новая, неизвестная болезнь. Ее симптомами были: головные боли с потерей зрения, паралич, ужасные стреляющие боли в разных частях тела, потом — слепота и смерть. По разным оценкам “кессонка” унесла, на бруклинском кессоне – до 50 жизней, на манхэттенском — около 100.Башни опираются на подводные кессоны, сделанные из южной желтой сосны. В обоих кессонах имеются внутренние помещения, которые использовались строителями. Кессон со стороны Манхэттена немного больше, Кессоны были спроектированы так, чтобы выдерживать по меньшей мере вес башен, которые при полной сборке оказывали бы давление в 49 тонн на квадратный метр, но кессоны были перепроектированы для обеспечения безопасности. Во время аварии на Бруклинской стороне, когда давление воздуха упало и частично построенные башни рухнули с полной силой, кессон выдержал расчетное давление в 220 т / м 2 с незначительными повреждениями. Кессон Бруклинской стороны, который был построен первым, первоначально состоял из пяти слоев древесины. Позже поверх потолка были добавлены еще десять слоев древесины, а весь кессон был обернут жестью и деревом для дополнительной защиты от затопления .Кессон со стороны Манхэттена был несколько иным, поскольку его пришлось устанавливать на большей глубине. Для защиты от повышенного давления воздуха на такой глубине на крыше манхэттенского кессона было 22 слоя древесины, на семь больше, чем у его бруклинского аналога. Практически любое грандиозное сооружение стоит на костях, но Бруклинский мост – на закипающей пенящейся крови. Работать надо было быстро, кессоны погружали и вынимали безо всяких церемоний. Рабочих в них называли «земляными свиньями» и платили им всего по $2 в час за тяжелейший труд: считалось, что землекоп – он и на дне реки землекоп, ничего особенного не происходит. Из-за дикого давления в куполе и его перепадов при быстрых погружениях и подъемах, у людей начиналась кессонная болезнь. Компрессия воздуха провоцировала выделение азота в организме, у человека в буквальном смысле бурлила и закипала кровь. За время строительства от «болезни водолазов» мучительно погибло более сотни человек. Жертвами кессонной болезни стали более 100 человек, несколько человек погибло, а многие стали инвалидами. Дела обстояли особенно плохо в боковой башне на стороне Манхэттена. Работники весь день дышали сжатым воздухом, поэтому, когда они подплыли к поверхности, у них не было времени приспособиться к новым условиям. Внезапное снижение давления, вызванное пузырьками азота, растворившимися в их тканях и крови, стало причиной сильных болей. Сегодня мы называем это состояние декомпрессионной болезнью. Одной из жертв кессонной болезни был сам Вашингтон Роблинг. Человек, отвечающий за строительство Бруклинского моста, перенес два изнурительных приступа и остался частично парализованным. Первые работы повлекли за собой возведение двух кессонов, на которых должны были быть возведены подвесные башни Кессон бруклинской стороны был построен и спущен на воду 19 марта 1870 года. В кессон был закачан сжатый воздух, и рабочие вошли в помещение, чтобы разгрести осадок, пока он не опустился до коренных пород. Как только кессон достигнет желаемой глубины, его предстояло заполнить вертикальными кирпичными опорами и бетоном. Однако из-за неожиданно высокой концентрации крупных валунов на дне реки бруклинскому кессону потребовалось несколько месяцев, чтобы опуститься на желаемую глубину. Кроме того, в декабре 1870 года загорелась его деревянная крыша, что еще больше задержало строительство "Большой выброс", как был назван пожар, задержал строительство на несколько месяцев, поскольку отверстия в кессоне пришлось заделывать. 6 марта 1871 года ремонт был закончен, и кессон достиг своей окончательной глубины в 13,6 м, пять дней спустя он был заполнен бетоном В целом, по оценкам, около 264 человек работали в кессоне каждый день, но из-за высокой текучести рабочих, итоговое число, как считалось, составило около 2500 человек .Несмотря на это, лишь несколько рабочих были парализованы. На конечной глубине давление воздуха в кессоне составляло 140 кПа Чтобы гарантировать, что он не загорится, как его аналог, кессон Манхэттена был облицован огнеупорным листовым железом. Он был спущен на воду 11 мая 1871 года, и маневрировал на месте в сентябре того же года. В период с 25 января по 31 мая 1872 года Смит вылечил 110 случаев декомпрессионной болезни. Когда железные зонды под манхэттенским кессоном обнаружили, что коренная порода залегает еще глубже, чем ожидалось, Вашингтон Реблинг остановил строительство из-за повышенного риска развития декомпрессионной болезни. После того, как манхэттенский кессон достиг глубины 23,9 м, при давлении воздуха 240 кПа , Вашингтон счел песчаный грунт, покрывающий скальную породу достаточно прочным, и впоследствии, в июле 1872 года, залил кессон бетоном.